Studi computazionali di complessi miRNA/proteine ​​utilizzando la dinamica molecolare e tecniche di machine learning
L'obiettivo del progetto è la caratterizzazione delle sequenze di miRNA modello isolate e della loro interazione con le molecole bersaglio, mediante studi di Dinamica Molecolare e attività di Machine Learning per la costruzione e l'utilizzo di un database di specie con stati di carica rappresentativi del miRNA e dei suoi complessi.

#fellowship #machinelearning #moleculardynamics #miRNA

L'obiettivo di questo progetto è fornire un'analisi teorica completa, coerente e accurata dei vari fenomeni che si verificano a seguito dell'eccitazione ottica di nanostrutture paradigmatiche, solidi e aggregati molecolari tramite impulsi laser ultraveloci e intensi.
A tal fine svilupperemo approcci numerici teorici e innovativi basati sull'accuratezza di tecniche ab-initio per lo studio della dinamica di sistemi portati fuori equilibrio da impulsi laser forti e brevi. Questi strumenti teorici e numerici verranno utilizzati per affrontare nanostrutture complesse fino a centinaia di atomi.
Si svilupperanno approssimazioni e tecniche per la soluzione delle equazioni che governano la dinamica fuori equilibrio nell'ambito della teoria delle funzioni di Green di non equilibrio. Le implementazioni numeriche saranno effettuate in codice open-source Yambo.

#Yambo #Out_of_equilibrium #Ab_Initio